Krótka historia Kościoła Santo Tomé
Założona w XII wieku
Oryginalna konstrukcja została zbudowana wkrótce po odzyskaniu Toledo spod panowania muzułmańskiego. Został on zbudowany na miejscu starszego meczetu, co było powszechną praktyką w tamtych czasach, mającą na celu przywrócenie chrześcijańskiej dominacji w regionie.
Odbudowany w XIV wieku
Na początku XIII wieku kościół został prawie całkowicie przebudowany przez Gonzalo Ruiz de Toledo, władcę Orgaz. Sfinansował projekt budowy i został tam później pochowany. Jego grobowiec stał się później tematem obrazu El Greco.
Barok i późniejsze dodatki
Na przestrzeni wieków elementy takie jak ołtarz główny i niektóre kaplice zostały dodane w stylu barokowym. Dzwonnica o konstrukcji Mudéjar jest jedną z niewielu pozostałości oryginalnej struktury meczetu.