- 1785: Juan de Villanueva, III. Charles tarafından Prado Müzesi'ni inşa etmek üzere görevlendirilir. Bina başlangıçta Doğa Tarihi Kabinesine ev sahipliği yapmak üzere tasarlanmış ve neoklasik tarzda inşa edilmiştir.
- 1819: Kral Ferdinand VII, eşi Kraliçe Maria Isabel de Braganza'nın teşvikiyle müzeyi Kraliyet Resimler ve Heykeller Müzesi olarak resmen halka açtı. İlk katalogda yaklaşık 300 resim yer alıyordu.
- 1881: Müzenin koleksiyonu, Baron Emile d'Erlanger tarafından bağışlanan Goya'nın Siyah Resimleri'nin de eklenmesiyle önemli ölçüde genişledi ve İspanyol sanatı zenginleşti.
- 1936-1939: İspanyolca İç Savaş sırasında Müze, 353 Resmi ve diğer hazineleri korumak için tahliye ederek Valencia, Girona ve nihayetinde Cenevre'ye taşımış ve İkinci Dünya Savaşı'ndan sonra geri getirmiştir.
- 1971-1997: Casón del Buen Retiro binası, 20. yüzyıl sanatını sergilemek üzere Prado Müzesi kompleksine dahil edilerek müzenin sergi alanı genişletildi.
- 2001: Büyüyen koleksiyonun yarattığı alan kısıtlamaları nedeniyle, Müzenin kapasitesini genişletmek için aynı alanda yeni bir bina inşa edildi.
- 2007: Genişletme projesi, yeni binayı orijinal yapıya içten bağlayarak, Müzeyi modernize ederek ve sergi ve ziyaretçi tesislerini artırarak tamamlandı.
- 2023: Üç milyondan fazla ziyaretçiyi ağırlayan Prado Müzesi, İspanyolca, İtalyanca, Flamanca ve diğer Avrupa başyapıtlarından oluşan seçkin koleksiyonlarıyla dünyanın önde gelen sanat müzelerinden biri olma özelliğini korumaktadır.